Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms