Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms