Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms