Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNPPD1Q9BV87 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms