Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RTKNQ9BST9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms