Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPIFA3Q9BQP9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms