Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PMCHL2Q9BQD1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms