Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
RETNLBQ9BQ08 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RETNLBQ9BQ08 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms