Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms