Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3R4Q99570 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms