Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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