Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms