Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANKRD27Q96NW4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms