Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SENP8Q96LD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms