Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms