Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LCORQ96JN0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LCORQ96JN0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms