Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms