Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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