Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YIPF6Q96EC8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms