Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TP53INP1Q96A56 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms