Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRG4Q92954 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRG4Q92954 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms