Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113Q902F9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms