Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms