Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms