Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIEQ8NEW7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms