Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD53Q8N9V6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms