Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LRRC17Q8N6Y2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC17Q8N6Y2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms