Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms