Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms