Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOT1Q8IXI2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms