Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHA9Q7RTU4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms