Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHMP1BQ7LBR1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHMP1BQ7LBR1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms