Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRIG3Q6UXM1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRIG3Q6UXM1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms