Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSAG1Q6PB30 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms