Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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