Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCID2Q5JVF3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms