Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNT1Q5JUK3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms