Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF2Q5BJF6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF2Q5BJF6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms