Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms