Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms