Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKDCCQ504Y2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKDCCQ504Y2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms