Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYTL3Q4VX76 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms