Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ODF4Q2M2E3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms