Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC27Q2M243 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms