Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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