Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLFQ16534 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLFQ16534 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLFQ16534 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms