Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDB1Q16531 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
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