Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA6Q16445 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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