Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC6Q16204 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms