Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK4Q16099 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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